Nuevas aventuras comienza para Mario y Sonic después de su última aventura junto. Mario y Sonic comparten el protagonismo juntos, explorando nueva aventuras y enfrentándose a nuevos enemigos para salvar el mundo. ADVERTENCIA: Habrá nuevos personajes creados por mi, los demás son pertenecientes a Nintendo y Sega.
Mario, Luigi, la princesa Peach, la princesa Daisy y un séquito de Toads y Yoshis son invitados al vecino Reino de las Flores por su gobernante, el Príncipe Florian, para ver una demostración de una Flor Maravilla; Grandes tesoros del Reino de las Flores que pueden deformar la realidad. Bowser interrumpe la ceremonia...