Üçüncü Haçlı Seferi döneminde, Haşhaşinler adıyla bilinen, Hasan Sabbah önderliğindeki tarihsel örgüt ile Tapınak Şövalyeleri arasındaki mücadele üzerine kurgulanmıştır. Oyunu oynayan kişi aslında 21. yüzyılda yaşayan, bağlandığı "Animus" adlı makine sayesinde genetik kodlarını taşıdığı geçmişindeki atalarının yaşadıklarına şahit olan Desmond Miles'ı yönetmektedir. Makine sayesinde anılarını izlediğimiz suikastçi ise Altaïr Ibn-La'Ahad'dır.

Seni kovalayan geçmişin ise kaçıp kurtulamazsın, yüzleşmekten başka bir çaren yok senin için gelecekler. Bildiğin her şeyi öğrenmek için gelecekler ve onları istediğini verdiğinde öldürülüp bir kenara atılacaksın. Kimsesiz mezarlığa gömülmek istemiyorsan harekete geçmenin tam zamanı yaşamak veya ölmek senin elinde eğer yeterince iyiysen hayatta kalacaksın. 2014 yılından beri...