Pagkatapos ng mga pinagdaanan nila ng Section E, ang buong akala ni Jay-jay ay maayos na ang sitwasyon nila. Pero paano kung malaman niyang kasinungalingan lang pala ang lahat? Magagawa pa rin ba niyang patawarin ang taong nanakit sa kaniya o hindi na? Season 2 of Ang Mutya ng Section E *** Ang buong paniniwala ni Jasper Jean "Jay-jay" Mariano, unti-unti na siyang natatanggap ng mga tao sa paligid niya. Naging malapit na siya sa mga kaklase niya at kahit na nagkakaroon pa rin ng gulo, pilit nilang inaayos ang mga iyon sa abot ng kanilang makakaya. Pero nang malaman niya ang katotohanan tungkol sa mga itinuring niyang kaibigan at pamilya, tila gumuho ang mundo ni Jay-jay. Hindi na niya malaman kung ano nga ba ang totoo sa hindi. Ngayong puno na ng sakit at hinagpis ang puso niya, magagawa pa rin ba niyang pakinggan at patawarin ang mga taong nanakit sa kaniya? O pipiliin niyang lumayo na lamang sa mga ito kahit na napamahal na siya rito?